Знаете, я, кажется, поторопился с оценкой этого плагина.
Он мерджит pdf из разных папок, но делает это не так, как нам нужно, например:
input:
\\issue_1\page1.pdf, page2.pdf, page3.pdf
\\issue_2\page1.pdf, page2.pdf, page3.pdf, page4.pdf
\\issue_3\page1.pdf, page2.pdf
output:
pdf1.pdf...