Не до конца уверен что правильно представляю картину, но у вас, по-моему, два варианта для работы с новым хранилищем.
1. Категорически своя сеть, отрезанная от предприятия. Со своим шлюзом в Интернет.
2. Перенастройка сети предприятия с выделением вашему отделу подсети.
Второй вариант, как я...