Нет. Все равно даже при создании нового документа выставляются мм из установок Илюстратора. По коду, я так понимаю, должны выставляться дюймы?
Но это все-таки немного не то. Смысл, чтобы при открытии любого файла, созданного, например в px, нажатием хоткея запускался скрипт переключающий линейки...